‘Napoleon Dynamite’ er en noget anderledes helt – komplet med afrohår, kiksede Moon Boots og evner ud over det sædvanlige. Napoleon bruger tiden på at tegne mytologiske uhyrer, tæve sin bror Kip og undgå sin luskede onkel Rico. Da to nye venner dukker op i Napoleons liv – den generte Deb og Pedro med overskægget – starter trekløveren en kampagne for at få valgt Pedro som elevrådsformand, så elevernes vildeste drømme kan gå i opfyldelse. Men hvis Pedro skal slå den populære Summer, er Napoleon nødt til at slippe sit hemmelige våben løs…