Officielt er Dronningens Vagtmester efterfølgeren til Gøngehøvdingen. Men bortset fra, at de 2 film foregår i samme miljø; delvis har de samme skuespillere, og begge er baseret på historiske romaner af Carit Etlar, kan de ses helt uafhængigt af hinanden. Vi er fortsat under Svenskekrigen 1657-60 - og København er belejret af de svenske tropper. Svend Gønge og hans tro følgesvend Ib hjælper med at bringe en adelig familie gennem de svenske linjer og er med til at smugle mad ind til den sultende by.