'De nøgne træer' handler om den jurastuderende Holger Mikkelsen, som tilslutter sig en sabotagegruppe, der i 1943 opererer mod den tyske besættelsesmagt i og omkring Århus. Han indleder et lidenskabeligt forhold til Gerda, der er gift med gruppelederen Christian. Det får konsekvenser for gruppens arbejde. Samtidigt fortælles om digterspiren Keld, der går ind i modstandsbevægelsen efter en ulykkelig kærlighedsaffære. Filmatisering af Tage Skou-Hansens roman af samme navn fra 1957.