'Balkan is Not Dead' foregår ved overgangen til det 20. århundrede, hvor en familie i Makedoniens anden største by Bitola forsøger at holde sammen og bevare sine rødder på trods af den osmanniske besættelse. I centrum for den stort anlagte filmfortælling står kærlighedshistorien mellem en tyrkisk officer – den senere præsident Mustafa Kemal Ataturk – og en af døtrene i familien, den smukke Eleni, der kæmper for kvinders rettigheder og afskaffelse af harem-traditionen.