I 'Shrek den Lykkelige' savner den grønne trold de gamle dage, hvor han følte sig som en rigtig trold.

Shrek bliver derfor narret til at underskrive en pagt med den indsmigrende Rumleskaft.

Pludselig befinder Shrek sig i en forskruet udgave af Kongeriget Langt, Langt Borte, der vender op og ned på alting.

Her bliver trolde forfulgt, Rumleskaft er konge og Shrek og Fiona aldrig har mødt hinanden.

I 'Shrek den lykkelige' er det nu op til Shrek at ophæve, hvad han har gjort, så han kan redde sine venner, genskabe sin verden og få sin eneste ene tilbage.