Ifølge myten forførte Jupiter en ung kvinde og sendte hende til en ø i Middelhavet. Pigen hed Europa. I dag er det filippinske Pepsi, der som en moderne Europa tager turen over grænser, gennem vildnis og urbane ødemarker i sin søgen efter en plads i en kaotisk verden. Flygtet fra den muslimske militærlejr hun er vokset op i på grund af sin homoseksualitet, og nu strandet i Paris. 'Shelter' er en postkolonial fabel, der - ligesom sin anonyme hovedperson - konstant skifter form. 16mm film, analog video og grynede iPhones bidrager til fantombilledet af et liv i den urbane undergrund. En voldsom og poetisk film i ånden fra Jean Genet.