Det massive fiskeri i Amazonas presser den unikke, lyserøde floddelfin mod udryddelse. Det ellers nysgerrige og tillidsfulde dyr bliver jaget og dets kød brugt som lokkemad til at fange ådselsfisk – en fladpandet malle, som bliver eksporteret i tonsvis. Delfinen forsvinder fra Amazonas’ floder og hele artens overlevelse er på spil. 'A River Below' kommer helt tæt på den kendte brasilianske biolog og tv-vært Richard Rasmussen, når han skrider til radikale handlinger for at få delfinen beskyttet. Men problemstillingen vendes pludselig på hovedet, da filmholdet præsenterer den excentriske biolog for indfødte fiskeres vrede over, at deres eneste indtægtskilde forsvinder ved fredning af mallen. Det afgørende og uafklarede dilemma, som instruktør Mark Grieco sætter i centrum, er paradoksalt nok hvem, der har mest brug for beskyttelse: dyrene eller menneskene?