'1898: De sidste på Filippinerne' tager afsæt i året 1898, hvor Spanien mistede kolonierne i Caribien og Filippinerne i den spansk-amerikanske krig. Intetanende om krigens udbrud har en gruppe spanske soldater forskanset sig i en kirke dybt inde i den filippinske jungle. Sult, desillusion og rygter om koloniens mulige fald forstærker gruppens indre splid.