Med ubegrænset adgang til Zappa-familiefonden og alt hvad der findes af arkivmateriale, udforsker musikfilmen ZAPPA den private eksistens, der lå bag en gigantisk musikalsk karriere, og som aldrig holdt sig tilbage for at gå i kødet på tidens politiske turbulens.   

Alex Winters dokumentar tæller gæsteoptrædener af Frank Zappas enke, Gail Zappa, og flere af Zappas musikalske samarbejdspartnere såsom Mike Keneally, Ian Underwood, Steve Vai, Pamela Des Barres, Bunk Gardner, David Harrington, Scott Thunes, Ruth Underwood, Ray White og mange andre.